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区室,指的是有界膜的细胞器,例如内质网,线粒体,叶绿体,高尔基体和过氧化物酶体等。
从细胞生物学角度,对细胞而言,绝大多数代谢途径都局限于细胞内的特定区域,也称为代谢途径的区室化。
而在发育遗传学上,区室是一个非形态学的概念,由具有相同发育潜能、相对独立的细胞群体构成。即为发育过程中,节中的相对独立的区域。